dnaman中文版是一款综合性的分子生物学道具,专为dna序列的对比策划,只要输入相关序列便可获取细致阐发并得出结论。它还包括绘图作用和随机序列生成器。对于学习生物化学的人来讲,这将是一个十分有效的道具。
dnaman官网介绍
dnaman是一款由lynnonbiosoft公司开辟的多作用分子生物学应用软件,集成了多种作用,可以简化并加速用户进行高效的序列阐发。无需安置多个程序,dnaman就能达成限制性酶切阐发、多序列比对、pcr引物策划、蛋白质序列阐发以及质粒提取等使命。
dnaman软件功能
- 限度阐发
- 多序列比对,对齐编纂和阐发
- 静音突变阐发建立/粉碎限度性位点
- 治理寡核苷酸,dna和蛋白质数据库
- dna序列组装和编纂
- pcr和测序引物的策划
- 绘制序列图与出书品格
- 电子克隆
- 从限度片断重修限度图
- sirna选择器
- 表征dna或引物序列的热力学性质
- 导向不匹配以建立/粉碎限度站点
- 翻译和明码子运用阐发
- blast经过网络界面在intranet / internet server上进行搜索
- 分歧阐发
- 反向翻译
- 蛋白质疏水性/亲水性阐发
- 生成随机序列
- 体系树阐发
- dna和蛋白质序列编纂
- 限度模式展望
- 序列和数据库中的增强型图案搜索
- 蛋白质二级构造展望2
- 蛋白质表征:等电点的序列构成和展望
- dna或蛋白质序列的点阵对比
- dna序列转化
特色说明
(2)序列比对
(3)限制性酶切阐发
(4)pcr引物策划
支持对dna序列进行限制性酶切位点阐发,协助用户策划试验计划,优化基因克隆和抒发。
供应种系发作阐发作用,经过构建进化树来钻研序列之间的同源性。
支持蛋白质序列阐发,囊括翻译、展望二级构造、阐发突变对蛋白质作用的影响等。
支持将多个短序列组装成完整的基因组或转录组,适用于基因测序后的资料拔除。
支持土产或长途资料库的序列搜索与治理,便利用户快捷查找和阐发指标序列。
供应pcr引物策划作用,用户能够依据指标序列快捷生成特异性引物,提升试验效力。
供应多个序列的比对作用,支持多种比对算法(囊括smith-waterman和needleman-wunsch),以揭露序列间的同源性和差异性阐发。
(7)同源性阐发
(6)序列组装
支持对dna、rna和蛋白质序列进行编纂,囊括增添、删除、修正和剪切等操纵,协助用户高效拔除序列资料。
(1)序列编纂与转换
(8)资料库治理
(5)蛋白质阐发
dnaman序列比对教程
输入终了,按下ctrl+a同时选中序列,并点击顶部seq地区符号进行编纂。
- 而后点击软件顶部的sequence选项,在弹出的选项中点击display,在二级菜单中点击rev.compl.sequence
- 在新建好的对话框中输入dna序列
- 张开在本站下载好的dnaman软件,张开软件后,点击软件顶部的点击file,在弹出的抉择中抉择new
- 而后就能够得到原序列的反向互补序列。
亮点优势
基因构造展望:
可将dna或rna序列转化为蛋白质序列,便于进行作用阐发和比对。
资料可视化:
供应引物策划道具,策划简并引物并生成列表,适用于pcr、基因克隆等多种试验用处。
强盛的序列比对作用:
引物策划:
支持插件体系,用户可通过安置插件来扩大软件作用,如进行体系发育阐发等。
能构建进化树,协助研究人员阐发物种或基因的进化汗青。
可以生成图表,供应多种资料可视化道具,协助用户更好地理解资料。
进化树阐发:
扩大性强:
支持建立、修剪、导入、拼接和解释序列,便利用户对序列进行拔除。
普遍支持多种比对算法,如nw、sw、psi-blast等,实现多序列比对,助力敏捷辨认序列间同源性和差距。
序列编纂与治理:
可辨认基因构造,展望启动子、外显子等,并在图形界面展示了局。
蛋白质翻译: